Evaluacija prikladnosti RNAskopa kao tehnike za mjerenje ekspresije gena u kliničkoj dijagnostici: Sistematski pregled.
Molecular diagnosis & therapy
Sažetak istraživanja
Cilj Procijeniti primjenu RNAskopa u kliničkom dijagnostičkom polju u poređenju sa trenutnim metodama 'zlatnog standarda' koje se koriste za testiranje nivoa ekspresije gena, uključujući imunohistohemiju (IHC), kvantitativni PCR u realnom vremenu (qPCR) i kvantitativni PCR reverzne transkriptaze (qRT-PCR) i za otkrivanje gena za detekciju situa DNAhyDSH (uključujući i DNAhyDSH).
Metode Ovaj sistematski pregled je pretraživao baze podataka CINAHL, Medline, Embase i Web of Science za studije koje su sprovedene nakon 2012. i koje su upoređivale RNAscope sa jednom ili više tehnika 'zlatnog standarda' u ljudskim uzorcima. QUADAS-2 test je korišten za procjenu rizika od pristrasnosti članaka.
Rezultati su pregledani narativno i kvalitativno analizirani.
Rezultati Ukupno je prikupljeno i recenzirano 27 članaka (sve retrospektivne studije). 27 članaka je pokazalo raspon od niskog do srednjeg rizika od pristrasnosti, kako je procijenjeno QUADAS-2 testom. 26 članaka proučavalo je RNAskop u uzorcima raka. RNAskop je upoređen sa različitim tehnikama tokom uključenih studija (IHC, qPCR, qRT-PCR i DNK ISH).
Rezultati su potvrdili da je RNAscope visoko osjetljiva i specifična metoda koja ima visoku stopu podudarnosti (CR) sa qPCR, qRT-PCR i DNK ISH (81,8-100%). Međutim, CR sa IHC je bio niži od očekivanog (58,7-95,3%), što je uglavnom zbog različitih proizvoda koje svaka tehnika mjeri (RNA naspram proteina). Diskusija Ovo je prvi sistematski pregled upotrebe RNAskopa u kliničkoj dijagnostici. Utvrđeno je da je RNAskop pouzdana i robusna metoda koja može nadopuniti zlatne standardne tehnike koje se trenutno koriste u kliničkoj dijagnostici za mjerenje nivoa genske ekspresije ili za detekciju gena. Međutim, nije bilo dovoljno podataka koji bi sugerirali da bi RNAscope mogao biti samostalan u kliničkom dijagnostičkom okruženju, što ukazuje da su potrebne daljnje prospektivne studije za validaciju vrijednosti dijagnostičke točnosti, u skladu s relevantnim propisima, nakon čega slijedi procjena troškova.
Prikaži originalni naslov i sažetak na engleskom
Evaluation of the Suitability of RNAscope as a Technique to Measure Gene Expression in Clinical Diagnostics: A Systematic Review.
Objective To evaluate the application of RNAscope in the clinical diagnostic field compared to the current 'gold standard' methods employed for testing gene expression levels, including immunohistochemistry (IHC), quantitative real time PCR (qPCR), and quantitative reverse transcriptase PCR (qRT-PCR), and to detect genes, including DNA in situ hybridisation (DNA ISH).
Methods This systematic review searched CINAHL, Medline, Embase and Web of Science databases for studies that were conducted after 2012 and that compared RNAscope with one or more of the 'gold standard' techniques in human samples. QUADAS-2 test was used for the evaluation of the articles' risk of bias. The results were reviewed narratively and analysed qualitatively.
Results A total of 27 articles (all retrospective studies) were obtained and reviewed. The 27 articles showed a range of low to middle risk of bias scores, as assessed by QUADAS-2 test. 26 articles studied RNAscope within cancer samples. RNAscope was compared to different techniques throughout the included studies (IHC, qPCR, qRT-PCR and DNA ISH). The results confirmed that RNAscope is a highly sensitive and specific method that has a high concordance rate (CR) with qPCR, qRT-PCR, and DNA ISH (81.8-100%). However, the CR with IHC was lower than expected (58.7-95.3%), which is mostly due to the different products that each technique measures (RNA vs. protein). Discussion This is the first systematic review to be conducted on the use of RNAscope in the clinical diagnostic field. RNAscope was found to be a reliable and robust method that could complement gold standard techniques currently used in clinical diagnostics to measure gene expression levels or for gene detection. However, there were not enough data to suggest that RNAscope could stand alone in the clinical diagnostic setting, indicating further prospective studies to validate diagnostic accuracy values, in keeping with relevant regulations, followed by cost evaluation are required.
Izvorni podaci
- DOI
- 10.1007/s40291-021-00570-2
- PMID
- 34957535
- PMCID
- PMC8710359
- Provjereno
- 2026-07-26
Naslov i sažetak prevedeni su automatski i prijevod može sadržavati netačnosti ili neprecizne stručne izraze. Za sve detalje, citiranje i medicinsko tumačenje pregledajte originalnu englesku verziju članka. Ne donosite zdravstvene odluke samo na osnovu ovog prijevoda.
Pregledaj originalni članak na engleskom