U kojim trenucima tokom infekcije SARS-CoV-2 se može otkriti i više se ne može otkriti pomoću RT-PCR testova? Sistematski pregled podataka o pojedinačnim učesnicima.
BMC medicine
Sažetak istraživanja
Pozadina Testovi na virusnu ribonukleinsku kiselinu (RNA) teškog akutnog respiratornog sindroma coronavirus 2 (SARS-CoV-2) koristeći lančanu reakciju polimeraze reverzne transkripcije (RT-PCR) ključni su za otkrivanje trenutne koronavirusne bolesti (COVID-19) i trajanja virusa koji se može otkriti što ukazuje na potencijal infektivnosti.
Metode Proveli smo sistematski pregled podataka o pojedinačnim učesnicima (IPD) longitudinalnih studija rezultata RT-PCR testa kod simptomatskog SARS-CoV-2. Pretražili smo baze podataka o živim dokazima PubMed, LitCOVID, medRxiv i COVID-19. Procijenili smo rizik od pristrasnosti koristeći QUADAS-2 adaptaciju. Ishodi su bili postotak pozitivnih rezultata testa prema vremenu i trajanju virusa koji se može otkriti, prema anatomskim mjestima uzorkovanja.
Rezultati Od 5078 pregledanih studija, uključili smo 32 studije sa 1023 učesnika zaraženih SARS-CoV-2 i 1619 rezultata testova, od - 6 do 66 dana nakon pojave simptoma i hospitalizacije. Najveći postotak detekcije virusa bio je iz nazofaringealnog uzorkovanja između 0 i 4 dana nakon pojave simptoma na 89% (95% interval pouzdanosti (CI) 83 do 93) opadajući na 54% (95% CI 47 do 61) nakon 10 do 14 dana. U prosjeku, trajanje virusa koji se može otkriti bilo je duže kod uzorkovanja donjeg respiratornog trakta (LRT) nego iz gornjih respiratornih puteva (URT). Trajanje detekcije fekalnog i respiratornog virusa uvelike je variralo unutar pojedinih sudionika. Kod nekih učesnika virus se još mogao otkriti 46 dana nakon pojave simptoma.
Zaključci RT-PCR propušta otkrivanje osoba sa infekcijom SARS-CoV-2; rano uzorkovanje minimizira lažno negativne dijagnoze. Nakon 10 dana nakon pojave simptoma, niži RT ili testiranje fekalija mogu biti poželjna mjesta za uzorkovanje. Uključene studije su otvorene za značajan rizik od pristrasnosti, tako da su stope pozitivnosti vjerovatno precijenjene.
Prikaži originalni naslov i sažetak na engleskom
At what times during infection is SARS-CoV-2 detectable and no longer detectable using RT-PCR-based tests? A systematic review of individual participant data.
Background Tests for severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) viral ribonucleic acid (RNA) using reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) are pivotal to detecting current coronavirus disease (COVID-19) and duration of detectable virus indicating potential for infectivity.
Methods We conducted an individual participant data (IPD) systematic review of longitudinal studies of RT-PCR test results in symptomatic SARS-CoV-2. We searched PubMed, LitCOVID, medRxiv, and COVID-19 Living Evidence databases. We assessed risk of bias using a QUADAS-2 adaptation. Outcomes were the percentage of positive test results by time and the duration of detectable virus, by anatomical sampling sites.
Results Of 5078 studies screened, we included 32 studies with 1023 SARS-CoV-2 infected participants and 1619 test results, from - 6 to 66 days post-symptom onset and hospitalisation. The highest percentage virus detection was from nasopharyngeal sampling between 0 and 4 days post-symptom onset at 89% (95% confidence interval (CI) 83 to 93) dropping to 54% (95% CI 47 to 61) after 10 to 14 days. On average, duration of detectable virus was longer with lower respiratory tract (LRT) sampling than upper respiratory tract (URT). Duration of faecal and respiratory tract virus detection varied greatly within individual participants. In some participants, virus was still detectable at 46 days post-symptom onset.
Conclusions RT-PCR misses detection of people with SARS-CoV-2 infection; early sampling minimises false negative diagnoses. Beyond 10 days post-symptom onset, lower RT or faecal testing may be preferred sampling sites. The included studies are open to substantial risk of bias, so the positivity rates are probably overestimated.
Izvorni podaci
- DOI
- 10.1186/s12916-020-01810-8
- PMID
- 33143712
- PMCID
- PMC7609379
- Provjereno
- 2026-07-26
Naslov i sažetak prevedeni su automatski i prijevod može sadržavati netačnosti ili neprecizne stručne izraze. Za sve detalje, citiranje i medicinsko tumačenje pregledajte originalnu englesku verziju članka. Ne donosite zdravstvene odluke samo na osnovu ovog prijevoda.
Pregledaj originalni članak na engleskom