Duga nekodirajuća RNA KCNQ1OT1 je prognostički biomarker i posreduje u iscrpljenju CD8 + T ćelija regulacijom ekspresije CD155 kod kolorektalnog karcinoma.
International journal of biological sciences
Sažetak istraživanja
Pozadina: Duga nekodirajuća RNK KCNQ1 suprotnog lanca/antisense transkripta 1 (lncRNA KCNQ1OT1) je abnormalno izražena u različitim čvrstim tumorima.
Svrha ove studije bila je da se istraži prognostička vrijednost i potencijalna funkcionalna uloga lncRNA KCNQ1OT1 kod karcinoma. Metode: Izvršili smo meta-analizu objavljene literature kako bismo procijenili prognostičku vrijednost lncRNA KCNQ1OT1 kod karcinoma. Verifikacija, funkcionalna analiza i analiza genomskih varijacija izvršene su korištenjem baza podataka GEPIA, TIMER i LnCeVar. Prema nivou infiltracije imunoloških ćelija, uspostavili smo prognostički model ekspresije lncRNA KCNQ1OT1 koristeći javne skupove podataka TIMER-a. Koristili smo kvantitativnu lančanu reakciju polimeraze u realnom vremenu (RT-qPCR) i western blot da bismo otkrili nivoe ekspresije lncRNA KCNQ1OT1 i CD155 proteina u tkivima i ćelijskim linijama kolorektalnog karcinoma (CRC). Zatim, lncRNA KCNQ1OT1-knockdown ćelijska linija je kokultivirana kako bi se istražila uloga lncRNA KCNQ1OT1 i CD155 u odgovoru T stanica pomoću protočne citometrijske analize. Rezultati: Naši rezultati su pokazali da je visoka ekspresija lncRNA KCNQ1OT1 značajno povezana sa lošim ukupnim preživljavanjem kod karcinoma, posebno CRC. Zanimljivo je da smo otkrili da pacijenti sa COAD sa visokom ekspresijom lncRNA KCNQ1OT1 i visokim nivoom infiltracije CD8 + T ćelija imaju lošiju prognozu od onih sa niskom ekspresijom lncRNA KCNQ1OT1 i visokim nivoima infiltracije CD8 + T ćelija. Štaviše, lncRNA KCNQ1OT1 i CD155 su pokazale značajno veću ekspresiju u CRC tkivu nego u normalnom tkivu, a ekspresija lncRNA KCNQ1OT1 bila je u pozitivnoj korelaciji sa ekspresijom CD155 u CRC. Konačno, nokdaun lncRNA KCNQ1OT1 smanjio je ekspresiju CD155 u ćelijama HCT116 i SW620 i poboljšao imuni odgovor u kokulturi sa CD8 + T ćelijama. Zaključci: Visoka ekspresija lncRNA KCNQ1OT1 značajno je povezana sa lošom prognozom pacijenata sa CRC i posreduje u odgovoru CD8 + T ćelija u CRC. Ovi nalazi ukazuju na to da je lncRNA KCNQ1OT1 prognostički biomarker i potencijalna imunološka terapijska meta za poboljšanje odgovora CD8 + T ćelija u CRC.
Prikaži originalni naslov i sažetak na engleskom
Long Noncoding RNA KCNQ1OT1 is a Prognostic Biomarker and mediates CD8 + T cell exhaustion by regulating CD155 Expression in Colorectal Cancer.
Background: Long noncoding RNA KCNQ1 opposite strand/antisense transcript 1 (lncRNA KCNQ1OT1) is abnormally expressed in various solid tumors. The purpose of this study was to explore the prognostic value and potential functional role of lncRNA KCNQ1OT1 across cancers. Methods: We performed a meta-analysis of published literature to evaluate the prognostic value of lncRNA KCNQ1OT1 across cancers. Verification, functional analysis, and genomic variation analysis were performed using the GEPIA, TIMER, and LnCeVar databases. According to the immune cell infiltration level, we established a prognostic model of lncRNA KCNQ1OT1 expression using public datasets of TIMER. We used quantitative real-time polymerase chain reaction (RT-qPCR) and western blot to detect the expression levels of lncRNA KCNQ1OT1 and the CD155 protein in colorectal cancer (CRC) tissues and cell lines. Then, a lncRNA KCNQ1OT1-knockdown cell line was cocultured to explore the role of lncRNA KCNQ1OT1 and CD155 in the T cell response by flow cytometric analysis. Results: Our results showed that the high expression of lncRNA KCNQ1OT1 was significantly related to poor overall survival across cancers, especially CRC. Interestingly, we found that COAD patients with high lncRNA KCNQ1OT1 expression and high CD8 + T cell infiltration levels had a worse prognosis than those with low lncRNA KCNQ1OT1 expression and high CD8 + T cell infiltration levels. Moreover, lncRNA KCNQ1OT1 and CD155 showed significantly higher expression in CRC tissue than in normal tissue, and lncRNA KCNQ1OT1 expression was positively correlated with CD155 expression in CRC. Finally, knockdown of lncRNA KCNQ1OT1 reduced CD155 expression in HCT116 and SW620 cells and enhanced the immune response in coculture with CD8 + T cells. Conclusions: High lncRNA KCNQ1OT1 expression is significantly correlated with poor prognosis of CRC patients and mediates the CD8 + T cell response in CRC. These findings indicate that lncRNA KCNQ1OT1 is a prognostic biomarker and potential immune therapeutic target for enhancing the CD8 + T cell response in CRC.
Izvorni podaci
- DOI
- 10.7150/ijbs.59001
- PMID
- 33994860
- PMCID
- PMC8120463
- Provjereno
- 2026-07-26
Naslov i sažetak prevedeni su automatski i prijevod može sadržavati netačnosti ili neprecizne stručne izraze. Za sve detalje, citiranje i medicinsko tumačenje pregledajte originalnu englesku verziju članka. Ne donosite zdravstvene odluke samo na osnovu ovog prijevoda.
Pregledaj originalni članak na engleskom