Sistematski pregled ekstremnih fenotipskih strategija za traženje rijetkih varijanti u genetskim studijama složenih poremećaja.
Genes
Sažetak istraživanja
Sekvenciranje egzoma se obično koristi za karakterizaciju rijetkih bolesti odabirom multipleksnih porodica ili singletona s ekstremnim fenotipom (EP) i traženjem rijetkih varijanti u kodirajućim regijama. Strategija EP pokriva oba krajnja kraja spektra bolesti i također je korištena za istraživanje doprinosa rijetkih varijanti nasljednosti složenih kliničkih osobina. Proveli smo sistematski pregled kako bismo pronašli dokaze koji podržavaju upotrebu EP strategija u potrazi za rijetkim varijantama u genetskim studijama složenih bolesti i istakli doprinos rijetkih varijacija genetskoj strukturi poligenskih stanja. Nakon procjene kvaliteta preuzetih zapisa, odabrali smo 19 genetskih studija koje su razmatrale EP da bi demonstrirali genetsku povezanost. Sve studije su uspješno identificirale nekoliko rijetkih ili de novo varijanti, a mnogi novi geni kandidati su također identificirani odabirom EP-a. Postoji dovoljno dokaza koji potvrđuju da EP pristup za pacijente s ranim početkom bolesti može doprinijeti identifikaciji rijetkih varijanti gena kandidata ili puteva uključenih u složene bolesti. Pacijenti sa EP mogu doprinijeti boljem razumijevanju osnovne genetske arhitekture uobičajenih heterogenih poremećaja kao što su tinitus ili gubitak sluha povezan sa godinama.
Prikaži originalni naslov i sažetak na engleskom
A Systematic Review of Extreme Phenotype Strategies to Search for Rare Variants in Genetic Studies of Complex Disorders.
Exome sequencing has been commonly used to characterize rare diseases by selecting multiplex families or singletons with an extreme phenotype (EP) and searching for rare variants in coding regions. The EP strategy covers both extreme ends of a disease spectrum and it has been also used to investigate the contribution of rare variants to the heritability of complex clinical traits. We conducted a systematic review to find evidence supporting the use of EP strategies in the search for rare variants in genetic studies of complex diseases and highlight the contribution of rare variations to the genetic structure of polygenic conditions. After assessing the quality of the retrieved records, we selected 19 genetic studies considering EPs to demonstrate genetic association. All studies successfully identified several rare or de novo variants, and many novel candidate genes were also identified by selecting an EP. There is enough evidence to support that the EP approach for patients with an early onset of a disease can contribute to the identification of rare variants in candidate genes or pathways involved in complex diseases. EP patients may contribute to a better understanding of the underlying genetic architecture of common heterogeneous disorders such as tinnitus or age-related hearing loss.
Izvorni podaci
- DOI
- 10.3390/genes11090987
- PMID
- 32854191
- PMCID
- PMC7564972
- Provjereno
- 2026-07-26
Naslov i sažetak prevedeni su automatski i prijevod može sadržavati netačnosti ili neprecizne stručne izraze. Za sve detalje, citiranje i medicinsko tumačenje pregledajte originalnu englesku verziju članka. Ne donosite zdravstvene odluke samo na osnovu ovog prijevoda.
Pregledaj originalni članak na engleskom